Hola @egoitz_gonzalez,
lo mejor a mi criterio en estos casos es probar los dos, y quedarte con el que más te guste.
El uso de herramientas de desarrollo es algo bastante personal, que tiene mucho que ver con qué herramientas ya se conocen y la forma de trabajar de cada uno: siempre nos resultará más cómodo algo que nos sea familiar por haber usado antes una herramienta parecida que algo totalmente distinto, por más que sus características técnicas sean imbatibles.
También cuentan, por supuesto, la potencia de la PC y el sistema operativo y la integración de la herramienta con este.
En mi caso, incluso uso diferentes herramientas según el tamaño del proyecto, ya que algunas ofrecen ventajas para manejar proyectos grandes entre muchas personas a costa de consumo de recursos, pero que si esas características no me hacen falta, prefiero correr herramientas más livianas.
Si tenés experiencia con Eclipse aunque sea para otros lenguajes y plataformas, vas a conseguir más productividad que con un entorno nuevo. Eclipse además es una herramienta muy madura y ámpliamente usada, con lo que hay mucho soporte (aunque tengas que buscarlo en Bing porque Google primará los resultados sobre sus propias herrameintas). Sin embargo Ecplipse es algo pesado y puede etner características que no te interesen, con lo que Android Studio será más ágil para proyectos de una sola persona.
Resumiendo: tienendo la posibilidad de probar ambos y sacar tus propias conslusiones, no la desaproveches!
Saludos cordiales.