Lo dicho en JavaFx FXML tengo este problema al leer de la consola de comandos y mostrar en pantalla. En la consola sale con rectángulos en vez de los caracteres con tildes.
La codificación del proyecto es UTF-8. Aquí lo tengo en GitHub: https://github.com/Aldair91/Comandos
https://drive.google.com/file/d/14RoFS-xFSFxX-BlYXwJTlDL90CrsxbiN/view